Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ilf3Q9Z1X4 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms