Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TapbpQ9R233 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms