Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vstm2bQ9JME9 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms