Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms