Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Hmgn5Q9JL35 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Hmgn5Q9JL35 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Hmgn5Q9JL35 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Hmgn5Q9JL35 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms