Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms