Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 2810029C07Rik-201ENSMUST00000180698 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm26511-201ENSMUST00000181400 1895 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Ggcx-201ENSMUST00000065906 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 9230112E08Rik-202ENSMUST00000189441 3352 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 1700019J19Rik-205ENSMUST00000216531 2813 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Trak1-211ENSMUST00000211187 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm45889-202ENSMUST00000211255 2358 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
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