Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clstn1Q9EPL2 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms