Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tvp23bQ9D8T4 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms