Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PudpQ9D5U5 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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