Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Snrnp35Q9D384 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snrnp35Q9D384 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snrnp35Q9D384 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms