Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Trappc6bQ9D289 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Trappc6bQ9D289 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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