Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms