Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ddx28Q9CWT6 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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