Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms