Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q99KU6 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q99KU6 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q99KU6 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q99KU6 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q99KU6 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q99KU6 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q99KU6 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q99KU6 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q99KU6 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q99KU6 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q99KU6 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q99KU6 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q99KU6 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q99KU6 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q99KU6 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q99KU6 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q99KU6 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q99KU6 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q99KU6 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q99KU6 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q99KU6 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q99KU6 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q99KU6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q99KU6 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q99KU6 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q99KU6 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q99KU6 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q99KU6 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q99KU6 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q99KU6 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q99KU6 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q99KU6 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q99KU6 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q99KU6 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q99KU6 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q99KU6 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q99KU6 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q99KU6 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q99KU6 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q99KU6 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q99KU6 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q99KU6 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q99KU6 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Q99KU6 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q99KU6 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q99KU6 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q99KU6 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q99KU6 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q99KU6 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q99KU6 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q99KU6 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Q99KU6 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Q99KU6 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Q99KU6 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q99KU6 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q99KU6 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Q99KU6 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q99KU6 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q99KU6 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q99KU6 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Q99KU6 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Q99KU6 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q99KU6 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q99KU6 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q99KU6 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q99KU6 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q99KU6 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q99KU6 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q99KU6 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Q99KU6 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q99KU6 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q99KU6 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q99KU6 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q99KU6 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Q99KU6 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q99KU6 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q99KU6 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q99KU6 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q99KU6 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q99KU6 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q99KU6 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q99KU6 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q99KU6 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q99KU6 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q99KU6 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q99KU6 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q99KU6 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms