Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Hps4Q99KG7 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Hps4Q99KG7 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Hps4Q99KG7 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Hps4Q99KG7 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Hps4Q99KG7 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Hps4Q99KG7 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Hps4Q99KG7 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hps4Q99KG7 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hps4Q99KG7 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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