Protein–RNA interactions for Protein: Q99JL1

Spef1, Sperm flagellar protein 1, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef1Q99JL1 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Spef1Q99JL1 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Spef1Q99JL1 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms