Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Rnf144aQ925F3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Rnf144aQ925F3 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Rnf144aQ925F3 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf144aQ925F3 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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