Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Slc14a2-201ENSMUST00000025434 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Adh6-ps1-201ENSMUST00000171054 2789 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Hoxc12Q8K5B8 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms