Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

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Length 584 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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OptnQ8K3K8 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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OptnQ8K3K8 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OptnQ8K3K8 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms