Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms