Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx8Q8CFD4 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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