Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Ifna6-201ENSMUST00000105146 570 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm15720-201ENSMUST00000117133 282 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm12072-201ENSMUST00000118293 715 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm23479-201ENSMUST00000158876 122 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Ifna11-201ENSMUST00000170428 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 A630023A22Rik-201ENSMUST00000178958 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm9869-201ENSMUST00000063858 375 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Ifna1-201ENSMUST00000094972 570 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm8754-201ENSMUST00000118391 520 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm12254-201ENSMUST00000134617 471 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 1700026D11Rik-205ENSMUST00000151417 789 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm17147-201ENSMUST00000164176 432 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm26611-201ENSMUST00000181449 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm40153-201ENSMUST00000197904 637 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm18862-201ENSMUST00000204643 933 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm44658-201ENSMUST00000207965 637 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 AC124772.3-201ENSMUST00000222535 575 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nhsl1Q8CAF4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nhsl1Q8CAF4 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm13898-201ENSMUST00000141865 610 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm17171-201ENSMUST00000168048 534 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Mir6396-201ENSMUST00000183603 111 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Rwdd2a-203ENSMUST00000185566 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm9273-201ENSMUST00000200606 715 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Bpifa5-201ENSMUST00000028986 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Slc25a14-208ENSMUST00000177710 1516 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhsl1Q8CAF4 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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