Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Fbxo38Q8BMI0 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Fbxo38Q8BMI0 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Fbxo38Q8BMI0 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fbxo38Q8BMI0 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Fbxo38Q8BMI0 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Fbxo38Q8BMI0 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Fbxo38Q8BMI0 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Fbxo38Q8BMI0 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Fbxo38Q8BMI0 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Fbxo38Q8BMI0 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Fbxo38Q8BMI0 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Fbxo38Q8BMI0 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Fbxo38Q8BMI0 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Fbxo38Q8BMI0 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Fbxo38Q8BMI0 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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