Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Atg4bQ8BGE6 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Atg4bQ8BGE6 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Atg4bQ8BGE6 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Atg4bQ8BGE6 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Atg4bQ8BGE6 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Atg4bQ8BGE6 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Atg4bQ8BGE6 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Atg4bQ8BGE6 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Atg4bQ8BGE6 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Atg4bQ8BGE6 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms