Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc50Q810U5 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms