Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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Lrfn4Q80XU8 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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Lrfn4Q80XU8 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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