Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1bQ7TSF1 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms