Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Shq1Q7TMX5 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Shq1Q7TMX5 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Shq1Q7TMX5 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms