Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms