Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmeff1Q6PFE7 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms