Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Mfsd13aQ6PDE8 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms