Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Mir1190-201ENSMUST00000116925 96 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
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NipblQ6KCD5 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
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NipblQ6KCD5 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
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NipblQ6KCD5 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
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NipblQ6KCD5 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
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NipblQ6KCD5 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
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NipblQ6KCD5 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
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NipblQ6KCD5 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
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NipblQ6KCD5 Trappc1-202ENSMUST00000102601 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
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NipblQ6KCD5 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
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NipblQ6KCD5 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
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NipblQ6KCD5 Gm27168-201ENSMUST00000183394 361 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
NipblQ6KCD5 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
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