Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Nop58Q6DFW4 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Nop58Q6DFW4 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Nop58Q6DFW4 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Nop58Q6DFW4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Nop58Q6DFW4 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Nop58Q6DFW4 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Nop58Q6DFW4 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Nop58Q6DFW4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Nop58Q6DFW4 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Nop58Q6DFW4 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Nop58Q6DFW4 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nop58Q6DFW4 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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