Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT5

Tpgs2, Tubulin polyglutamylase complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs2Q66JT5 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tpgs2Q66JT5 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms