Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms