Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms