Protein–RNA interactions for Protein: Q62059

Vcan, Versican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcanQ62059 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Gm7781-201ENSMUST00000117258 788 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Rpl10-ps6-201ENSMUST00000121321 642 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Rpl10-ps5-201ENSMUST00000212707 642 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Gm3379-201ENSMUST00000222259 642 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Gm15570-201ENSMUST00000122093 625 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VcanQ62059 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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VcanQ62059 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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VcanQ62059 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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VcanQ62059 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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VcanQ62059 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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VcanQ62059 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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VcanQ62059 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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VcanQ62059 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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VcanQ62059 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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VcanQ62059 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VcanQ62059 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Gm43103-201ENSMUST00000199021 802 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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