Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms