Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Mtfr1-204ENSMUST00000130645 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Ttk-202ENSMUST00000185913 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Gm37608-201ENSMUST00000195696 1880 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam71bQ5STT6 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms