Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Znrf3Q5SSZ7 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms