Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Trim58Q5NCC9 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Trim58Q5NCC9 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Trim58Q5NCC9 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Trim58Q5NCC9 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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