Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

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Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spire1Q52KF3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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