Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm28047Q3US59 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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Gm28047Q3US59 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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Gm28047Q3US59 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Gm28047Q3US59 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Gm28047Q3US59 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Gm28047Q3US59 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28047Q3US59 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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