Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
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Ssbp4Q3U4B1 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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Ssbp4Q3U4B1 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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Ssbp4Q3U4B1 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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Ssbp4Q3U4B1 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
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Ssbp4Q3U4B1 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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Ssbp4Q3U4B1 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
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