Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
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Rnf40Q3U319 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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