Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Rnf149Q3U2C5 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Rnf149Q3U2C5 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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Rnf149Q3U2C5 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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