Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 P2ry14-206ENSMUST00000197841 2476 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
InipQ3TXT3 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms