Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms